Les Jupyter notebook peuvent faire office de cahier de manip électronique pour un bioinformaticien. Ils supportent de nombreux langages de programmation. Leur format prend toute son utilité lorsque l'on veux écrire des tutoriels car le code et les résultats ne sont pas dissociés. Ils peuvent être convertis en html, pdf, Markdown, presentation (beamer), ...
- au paratage des connaissances;
- à permettre à la communauté francophone d'avoir un repo de bioinfo (ceci n'exclus pas l'anglais dans les commentaire);
- à proposer une optimisation du code proposé (les benchmarks sont encouragé);
- découverte de nouveaux package/library (R/python);
- les idées sont les bienvenues;
Toute personne peux ouvrir une 'issue' ou proposer un 'pull request'. Pour l'instant la seule recommandation est d'ajouter les fichiers '.ipynb' dans un dossier comportant le nom du langage utilisé.