Программа развёртывания и свёртывания src-db-VCF по полю ALT

[PlatonB]

Раз задумка касается только VCF, то проге быть плагином.

Прототип:

Если с $unwind-стадией всё просто, то с формированием $group придётся чуть повозиться:

1. Собрать имена всех полей (N штук) исходного VCF в список;
2. Добавить в $group ID в качестве _id;
3. Сгенерировать N $first-выражений, вставив туда вышеупомянутые имена полей;
4. Добавить эти выражения в $group;
5. Для ALT заменить $first на $push.

[PlatonB]

Надо предусмотреть случай наличия полей GT. К примеру, 1/3 должно превращаться в трижды 1/1. И наоборот. Как это сделать силами MongoDB $group, пока не знаю.